《临证指南医案》共辑选叶氏临证验案二千五百六十九例，据病症类分为八十九门，每门以病证为标目，序列其经治医案，言简意赅。切中肯綮，于学术多有所体悟，于后学启迪甚多。每门之末附有论述该门证治大要的附论一篇，以总括叶氏医术之要，系由叶氏门人分别执笔撰写而成。卷一至卷八列内科病案，凡时症、杂病等；卷九为妇科；卷十为幼科。书末另附叶氏常用方剂，以备检阅。