描述在美丽的澳大利亚大堡礁海域中，活泼好动的小丑鱼“尼莫”，不幸被专门收藏观赏鱼的潜水人士捕捉，被卖入悉尼一间牙科诊所中，成为鱼缸中众多观赏鱼的一分子。“尼莫”开始必须面对一群陌生又怪异的新朋友，还得担心如何能与父亲“马林”团聚；而另一方面，心急如焚的“马林”决心要远渡重洋试图找到“尼莫”，沿路上还遇见了热心助人，却只有短暂记忆的帝王鱼“多莉”，他们不怕危险并展开冒险旅程，而“马林”是否能顺利地营救“尼莫”，父子重新团圆呢？